近日，上海交通大学张江高等研究院DNA存储研究中心左小磊、李敏团队在Nature Protocols发表题为 “Functionalized tetrahedral DNA frameworks for the capture of circulating tumor cells”的实验方法论文，系统阐述了精确自组装四面体框架核酸探针的设计、制备、表征，并建立了循环肿瘤细胞的高灵敏捕获方法。

以循环肿瘤细胞检测为代表的液体活检在肿瘤早期诊断、肿瘤分子分型、预后判断、肿瘤治疗效果评估等方面发挥着关键性作用。常规的循环肿瘤细胞捕获方法建立在抗体或核酸适体对肿瘤细胞膜表面抗原的识别，然而这种基于单一结合作用的分子识别模式（1：1）通常导致较低的捕获效率。针对这一关键问题，左小磊、李敏团队采用精确自组装框架核酸来合成具有特定结构的拓扑适配体，将循环肿瘤细胞的识别模式由单一结合作用（1：1）提升至拓扑诱导的多价结合作用（n：n），显著提高了细胞识别效率。该工作详细描述了如何设计功能化框架核酸进行循环肿瘤细胞（CTCs）捕获。主要包括功能化框架核酸的合成、表征，框架核酸与细胞结合性能验证以及如何利用框架核酸进行细胞捕获和下游分析。相关研究正应用于评估肿瘤治疗效果的临床研究中。

该工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目支持，上海交通大学博士研究生陈怡蓉为该论文的第一作者，左小磊研究员和李敏副研究员为通讯作者。

论文信息：https://www.nature.com/articles/s41596-023-00943-3